Witaj Pentuer,
Opcja "Clone chart" klonuje cały wykres z nałożonymi obiektami więc powinieneś mieć wszystko identycznie zachowane. Fakt, że w takiej opcji nowy wykres trafia na koniec kolejki na górnej zakładce. Ma się pojawić opcja przesuwania ich kolejności za pomocą myszki w przyszłości ale na razie trzeba zadowolić się innym sposobem.
Musisz sobie zaplanować jak chcesz aby te wykresy były poukładane, a następnie odłączyć dany wykres od platformy (undock - w tytule wykresu). Zamknięcie wykresu X'em sprawia, że trafia on na koniec.
Jeśli potem chcesz je porozmieszczać jakoś na monitorze to albo robisz to ręcznie albo korzystasz z jednej z opcji autorozmieszczania (klik prawym na tytuł wykresu

rozmieść).
Jeśli nadal będziesz miał z czymś problem to daj znać.